色滲透發生機理除了與顏料本身的特性如分子量、受水作用影響程度有關外，還與薄膜的特性有關。

顏料對薄膜的擴散滲透受聚合物分子的極性、結晶度、密度、分子排列的影響，取決于薄膜聚合物中高分子鏈進行熱運動時，高分子之間形成孔穴的大小，以及當溫度提高時孔穴擴張的情況。擴散滲透主要在非結晶區域進行。當溫度較低時，顏料是不容易穿過薄膜的，這是因為低溫時，顏料分子的能量較低，既不易克服分子間力，同時高分子鏈段的運動幅度較小，不足以產生顏料分子通過所需要的較大孔穴。對于經過拉伸定向以及結晶度較高的薄膜如PET、BOPP、HDPE等，由于分子排列規整度較高，即使在較高的溫度下，其總蠕變量、蠕變速度仍然較低，分子鏈段運動困難，所以這類薄膜一般難以發生顏料色滲透問題。但對于尼龍、非線性聚乙烯等類型的薄膜來說，由于是無定型態，結晶程度低，分子間隙大，在較高溫度時就易發生色滲透現象，特別是尼龍有熱變形溫度不高、尺寸不穩定、吸水量大、遇熱水易降解等缺點，所以用尼龍薄膜制作的蒸煮袋、水煮袋使用時，容易滲透某些顏色。但在干燥狀態時，這些顏料對尼龍薄膜的滲透作用減弱，這是因為消除了水分對尼龍薄膜及顏料的雙重影響。

墨層中聯結料色滲透的影響不是很強烈，這是因為顏料分子既然能克服內部分子間力運動，一般也就能克服顏料分子與聯結料中樹脂分子之間的作用力，而沖破聯結料的“包圍”發生遷移。但聯結料中樹脂分子的極性對顏料分子的運動遷移是有影響的，極性越強，遷移就越困難。例如青蓮色、桃紅等顏料在用松香樹脂制作成的膠版油墨中的遷移程度，比在普通凹版復合油墨(氯化聚丙烯型)低，也就是這個原因。